《铁齿铜牙纪晓岚3》由“好女争锋”、“假作真来真亦假”、“江湖江湖”、“辨奸计”和“胭脂红”五个单元故事组成。故事由神秘的江南女子陆琳琅（张庭饰）的出现而变得一波不平一波又起。陆姑娘深受乾隆（张铁林饰）宠爱，暂住纪晓岚（张国立饰）府上。然而和珅（王刚饰）早知陆姑娘身世， 为斩草除根，多番设计陷害陆姑娘。幸得纪晓岚解救，并一洗陆家冤情。然而这三个老男人却都陷入了儿女情长的重重矛盾中，本不平静的京城更是风波不断。
露芜衣是神秘组织无相月最小的九尾狐，性格活泼，狡黠。在寻找大妖小唯的任务中，她潜入了洛安韦府，然而她发现自称为小唯而来的不止她，还有以妖身画皮为法师，身负血海深仇的武拾光，与她同来的姐姐，面似春水心有足谋，同为九尾狐的雾妄言，以及看似天真，却身份存疑的侍鳞宗法师寄灵 。 在找寻真相的过程中，众人既有试探也有合作。他们都是为了小唯身上的龙神之力而来，但他们背后的目的却各不相同，有人想要守护，有人为了杀戮。 在一次次对于龙神之力的争夺中，他们成为了朋友，恋人，但也发现了彼此之间横亘着无法消弭的阻碍。为了消灭造成这阻碍的源头——万妖之首九婴，守护人间的和平，四人不得不在爱情、友情甚至是生命面前做出艰难的抉择和割舍，一次次努力地改变命运的流向。 画皮之下，是人性的善恶交锋，是命运的无常捉弄，更是对真爱与救赎的永恒追问。
凌渊在一次偶然中救了罗一，但罗一实为二皇子凌骁的棋子，目的是挑拨凌渊与东凌皇的父子关系。罗一在任务中真爱上了凌渊，但忠诚让她不得不伤害他。凌渊在权力斗争中逐渐变得冷酷，而罗一则被囚禁。三年后，罗一逃出囚禁，却发现凌渊已失忆，变成了一个冷酷的统治者…
背负双重心债的孤女黎慕荷，借沈家大小姐“沈念”之名归来复仇，一纸婚书嫁与冷面少帅陆岳霆。这场始于算计的联姻，却成了她最坚实的依靠。她周旋于继母、商会与药堂之间，他始终是她背后的利刃与盾牌，然而老战友携战场旧案突然出现，揭开指向陆岳霆的疑云。爱恨纠缠间，家族阴谋与敌国侵略接踵而至。最终，她在硝烟中直面一切恩怨，褪去所有伪装，以真实姓名与真正爱她之人携手共赴家国未来。
奴籍少女楚乔被燕北世子燕洵所救后两人结下深厚友谊，楚乔力助燕洵，但燕洵却以楚乔为饵，设伏诛杀大夏世家公子诸葛玥，诸葛玥与楚乔一起跌入冰湖。楚乔获救后，寻机刺杀燕洵，为诸葛玥报仇。燕洵逃回燕北后一意孤行要攻打大夏，当初的屠龙少年终成恶龙，他对楚乔也由爱生恨，不择手段想让她臣服自己。楚乔一边对抗燕洵，一边怀疑与自己一同跌落冰湖的诸葛玥其实还活着，于是努力寻找他的下落。她在帮助卞唐平定内乱时得到一位神秘的男子几次三番的救助，楚乔对他有种似曾相识的感觉，原来他就是诸葛玥。最终楚乔平定四方征战，与官兵和百姓并肩携手一起守护美好家园。
商会千金赵春漫（吉舒亦 饰）为父报仇潜入玉春戏院，却不幸死于义帮二当家周迟（边天扬 饰）之手。时间重置，赵春漫发现事情似有不同。为查清父亲死亡真相，改变自己的结局，春漫一次次面对命运的抉择，步步为营，也在与周迟的感情中攻城略地。
数千年前，仙族饕餮厨神瑶灵儿在极寒之地渡劫失败，渡劫雷火却意外导致被封印多年的青丘狐妖重获自由并救走命悬一线的瑶灵儿。为躲避仙族的追捕，瑶灵儿把青丘狐妖带回自己的仙居一起养伤，多年过去，两人暗生情愫。瑶灵儿的大师兄墨楠上仙发现了两人相爱，使计让两人误会反目，狐妖怀恨身亡，瑶灵儿为化解其恨两人下凡历劫。凡间狐妖化身夏逍遥，儿时家破人亡一心复仇，瑶灵儿助他调查真相。几年相处中两人历尽磨难破解了一件又一件狐火奇异事件，也逐渐解开了之前的心结再次相爱。
小城桦林，此时，出租司机王响（范伟 饰）做梦也没想到，他还有机会遇到一个他此生最想遇到，又最怕遇到的人。是仇人还是故人？遇到了，就得有交代，给自己，也给儿子。
很久以前,有一片神秘的国度武林大陆，以五大武林学院为首。
该剧以雍国外交机构“四方馆”为背景，讲述身处这一片小小天地中的元莫（檀健次 饰）、阿术（周依然 饰）、王昆吾（杜淳 饰）、尉迟华（阚清子 饰）等四方志士胸怀理想，为家国和正义勇敢奔赴、砥砺前行的故事。
南北朝时期，秦叔宝（黄海冰饰）幼年父亲便惨遭杀害，更目睹隋兵肆意欺压百姓的世态，立志行侠仗义，后于在山东历城当了一名捕快，人称小孟尝。隋唐末年，隋文帝次子杨广（谢君豪饰）欲谋篡位，李渊为了避难，携全家离京返乡，途中幸得秦叔宝搭救。秦叔宝到达山东不久，杨广谋便篡夺了皇位。被判重刑的程咬金（林子聪饰）出狱后，与绿林好汉单雄信（任山饰）劫富济贫粉碎了隋军的多次征讨。深谋远虑的李世民（郑国霖饰）广纳贤才，招纳秦叔宝、程咬金、罗成（聂远饰）、徐茂公（谭建昌饰）、尉迟恭（寇占文饰）、裴元庆（释小龙饰)等英雄好汉率兵扫平了十八路反王。瓦岗寨起义后，群雄协力助李世民平定天下。
正魔争斗千年。正道领袖风月剑尊、魔教星主凤行天生死决战。两人的后辈沈少游、凤离雪却因机缘巧合结成好友。为保护师父，沈少游失手将离雪推下悬崖。离雪被魔教第一高手重华救起带走。两人的命运从此改写。离雪将成为魔教教主。而沈少游却将成为正道的盟主，注定了要相遇相杀。十年后，两人重逢。离雪利用少游的愧疚潜伏在他身边，几次刺杀。却最终被少游的宽容、善良打动，情愫暗生。就在离雪决定放下父仇，改恶向善时，重华强加干涉，设计让两人彼此误会、仇恨。最终，离雪成为教主，与盟主沈少游决战。历经磨难后，两人感受到彼此的真心，最终再度携手。无论出身正邪，无论成长于仙境魔域，只有一件事始终不变：心中的正义与爱。
一朵琼花带血复生，引出前朝复仇之谋；十二铜人蚀骨熔金，原是天枢杀机之谜；大案弥天，对手诡谲；狄公重临，匡扶正义；武朝迷案未了，狄仁杰重出江湖；神探经典，精彩再现。
